← 返回主页
|
拆峰代码已开源
拆峰
赶尾人AB1拆重叠峰工具
支持 .ab1 测序文件 · 如有重峰,加载后自动拆分两条碱基链
+ 加载 AB1 文件
参数设置
完整峰图
拆峰结果
G
A
T
C
拟合 / 拆峰参数
以下参数在本次页面会话中生效(已保存到本机,刷新页面仍在):点击“确定”后,直接按新参数重算当前序列;关闭页面后恢复默认值。(鼠标悬停于峰图上可查看该点对应的真实坐标)
H(拟合最小峰高)
拟合出峰:信号高度须大于该阈值才视为峰(py 原版 height_limit=100)。调低可纳入矮峰,调高可滤掉噪声小峰
Trace_Back_Base(前溯位数)
回溯时链2 相对链1 允许的最大错开位数(默认值 4,意为允许双峰错开3位)
FIND_RANGE(补峰搜索范围)
序列寻找:找备选峰时,在主峰 ±FIND_RANGE 格内搜索(默认 4,在主峰x值±范围内寻找)
STEP(碱基步进间距)
序列寻找:主链下一位 = 当前峰位 + STEP 格(默认 12,碱基x值标准间距)
POSS(备用峰判定倍数)
序列寻找(ab1SeqPy):±FIND_RANGE 内候选峰峰幅 > 主峰 × 该值才作为备选碱基(默认 0.1)
仅从拟合点挑选备用点
勾选后:备选碱基只取拟合出的峰(第二峰图标点的峰);不勾选(默认):增加补查“该峰位 x 处其他通道的原始信号”,若 > 主峰 × POSS 也作为备选碱基,以增加灵敏度
恢复默认
取消
确定
复制区间 / 去 blast
起始位(1 基)
复制内容或 blast 查询的第一个字符位置(上下箭头每点一次 ±10 位)
结束位(1 基)
复制内容或 blast 查询的最后一个字符位置(含该位;上下箭头每点一次 ±10 位)
取消
去 blast
复制区间